En el Estado, existen algunas áreas naturales protegidas (ANP) estas son porciones terrestres o acuáticas del territorio nacional representativas de los diversos ecosistemas, en donde el ambiente original no ha sido alterado y que están sujetas a regímenes especiales de protección, conservación, restauración y desarrollo.
A continuación te nombraremos algunas: La Isla del Tiburón, La Pintada, El Pinacate y Gran Desierto de Altar, Mesa del Capanero Arroyo, Cuchujaqui, Alto Golfo y Delta, Bahía de las Islas de San Jorge, Ruta de los Misioneros, Ruta de Río Sonora, Ruta Yecora, Ruta Sierra Mar y Ruta Sierra Alta.
