Nacido el 13 de febrero de 1979 en Zamora, Michoacán es un destacado futbolista mexicano y se le conoce como el eterno capitán de la selección mexicana ya que ha disputado 4 mundiales y en todos ha portado el gafete de capitán.
Su debut en el fútbol mexicano lo hizo con el equipo Atlas en 1996 con quien llegó a disputar una final contra el Toluca la cual perdieron en penaltis, pero desde siempre Rafa Márquez ha dicho que es Rojinegro de Corazón.
Su experiencia como jugador internacional empezó con el AS Mónaco equipo con el que debutó el 14 de agosto de 1999 en el partido AS Mónaco 4-0 Bastia. En su primera temporada conquistó la Liga francesa. Además, fue distinguido como el defensa central ideal de la liga en la temporada 1999-2000. En el 2003 consiguió la Copa de la Liga de Francia. Con estos logros los grandes de Europa lo empezaron a buscar.
Finalmente el decidió jugar con el Barcelona y durante los años que ahí estuvo formó parte del mejor equipo del mundo como uno de sus pilares ganando un sinfín de torneos y quitándole la superioridad al Real Madrid en el torneo local y en Europa durante sus años de blaugrana. Antes de su salida del Barça en verano de 2010, tras completar el "sextete" y conseguir una nueva Liga española, Márquez acabó siendo el octavo extranjero con más partidos jugados con el club catalán. Estuvo siete temporadas en el Barcelona y decidió buscar nuevos retos pese a que tenía contrato en vigor.
El Regreso al continente americano fue la siguiente parada de Márquez con el New York Red Bulls quien lo fichó el 2 de agosto del 2010 y después de dos año Márquez rescindió su contrato con el equipo neoyorkino.
Pero sus ganas de seguir jugando y ganar título aún no terminaban así que se comprometió con el Club León de la Primera División mexicana y ganó un bicampeón de la Liga MX como capitán del equipo.
Pero le faltaba un sueño por realizar jugar en la serie A de Italia así que el 4 de agosto de 2014, Rafa fue presentado como nuevo jugador de Hellas Verona con no tan buenos resultados. Hoy juega nuevamente para el equipo de sus amores el Atlas y parece que ahí acabará sus días como futbolista.
